O desejo de criar uma Escola de preparo missionário na MISPA era antigo. Desde 1997, a diretoria pensava sobre isso e aguardava o momento oportuno.
Com o passar dos anos e buscando a direção de Deus, em 2008, perceberam que havia chegado o momento certo, sendo assim, em janeiro de 2009, fundou-se a EMPA, na direção do Pr. Florencio Moreira de Ataídes.
Ligada à MISPA, tem a finalidade de preparar e capacitar com excelência obreiros com ampla visão para o trabalho missionário e, então, serem enviados às nações.
Hoje, a Escola oferece: Curso de Capacitação Missionária Integral, Curso de Conscientização Missionária à Distância, Curso de Capacitação para Líderes de Crianças e Curso de Liderança Cristã.